原標(biāo)題：古DNA技術(shù)有怎樣的發(fā)展

高通量測序，又叫“二代測序”，是一種快速測定大量DNA序列的技術(shù)。在高通量測序普及之前，古DNA領(lǐng)域只能依賴PCR技術(shù)測定少數(shù)特定DNA片段的序列。這種方法獲取的DNA信息極其有限，而且難以區(qū)分真正的古DNA和污染DNA。高通量測序理論上能測序樣本中所有DNA分子的信息，且成本逐年降低。即使是含量極低的古DNA，也能很有效地對其進(jìn)行測序。不僅如此，通過生物信息學(xué)手段（如mapDamage軟件），我們還能快速檢測樣本中是否存在古DNA損傷，從而達(dá)到鑒別古DNA的目的。這一方法，也成了領(lǐng)域中古DNA檢測的重要標(biāo)準(zhǔn)。

盡管高通量測序已能較為有效地測序古DNA，但由于古DNA提取物中常常包含大量污染DNA，使得測序的大部分DNA分子都是無用的信息，真正有用的古DNA序列常常只占測序數(shù)據(jù)的1%不到。對此，研究人員在古DNA領(lǐng)域研發(fā)應(yīng)用了DNA捕獲技術(shù)——通過設(shè)計(jì)DNA或RNA探針，像釣魚一樣把目標(biāo)古DNA從海量的污染DNA中“釣取”出來。這項(xiàng)技術(shù)廣泛應(yīng)用于人類古基因組研究中，目前超過2/3的人類古基因組數(shù)據(jù)來自一個(gè)叫“1240k”的探針組的捕獲數(shù)據(jù)。DNA捕獲技術(shù)不僅使得對古DNA的測序效率大大提高，還能有效從一些“棘手”的樣本中得到足夠的數(shù)據(jù)用以分析。

來源： 光明日報(bào)

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